Для сохранения разнообразия природы и обеспечения благоприятного состояния, находящихся под угрозой вымирания видов и их мест обитания, взято под охрану 21% сухопутной и 29,2% водной территории Эстонии.
В Эстонии всего 4657 охраняемых природных объектов, из них:
- 6 национальных парков;
- 242 природных заповедников;
- 150 ландшафтных заказников;
- 443 парка и древостоя;
- 308 охранных территорий;
- 2275 постоянных местообитаний;
- 125 мест нереста и обитания;
- 1070 памятников природы;
- 34 природных объектов, охраняемых на уровне местного самоуправления;
- 4 территорий со старым, необновленным порядком охраны.

Глухарь. Фото: Яанус Танилсоо