Пухтулайд был заселен в середине XVIII века, когда местный уездный советник и помещик Карл Тхуре фон Хельвиг построил на острове дачу, а рамень был превращен в парк в голландском стиле. На острове был построен так называемый «китайский дом», а также целый ряд небольших домиков и павильонов. Помещик фон Хельвиг был также неплохим каменотесом, который создал несколько десятков памятников своим родственникам. Некоторые памятники сохранились до сегодняшнего дня и собраны в небольшой ложбине на южной оконечности полуострова. Самый старый и известный памятник был создан в честь известного писателя Фридриха Шиллера. Он был установлен Доротеей, дочерью Карла Тхуре, которая была подругой супруги известного писателя, Шарлотты. Сейчас осколки оригинала памятника находятся в Ляэнемааском музее. В парке Пухту можно увидеть также изготовленную Паулем Норма копию, которая несколько отличается от оригинала.

Во второй половине XIX века Виртсуская баронесса Элизабет фон Икскюль превратила Пухту в парк в английском стиле: на смену прямым дорожкам пришли извилистые тропы, а лесонасаждениям и кустам позволили расти естественным путем. В то время в парке Пухту стояли семейный дом, харчевня, несколько домов на одну семью и павильоны. В парке было проложено 7 км песчаных дорожек, которые разравнивались каждое утро. Возле семейного дома был разбит цветник. За ним простирался природный лесолуг, на котором росли самые старые дубы острова.

Во время Первой мировой войны на Пуйтлайд располагалась авиабаза русских гидросамолетов с плавучим причалом на западном берегу острова. Перед уходом были разрушены и сожжены почти все здания, за исключением построенной в 1857 году усадьбы с конюшней. С 1928 по 1940 год Пухтулайд принадлежал профессору Якобу Иоганну Икскюлю. Им же в южной части полуострова была построена дача, где сейчас располагается биологическая станция Пухту-Лаэлату. В 1934 году ухаживать за островом пригласили натуралиста и орнитолога-любителя графа Александра фон Кайзерлинга, который прожил в усадьбе на Пухту до 1939 года. Затем покидающий Эстонию Якоб Иоганн Икскюль продал свое владение Тартускому университету, и с 1949 года по сегодняшний день Пухтулайд принадлежал разным научным учреждениям.

В середине XIX века между Виртсу и Пухтулайд, на заливе шириной 700 метров были построены дамба и мост.  В 1952 году вместо моста  была построена каменная дамба, и с этого времени Пухтулайд является полуостровом.